Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKOR2Q2VWA4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKOR2Q2VWA4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms