Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSNAXIP1Q2TAA8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms