Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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