Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GEN1Q17RS7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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