Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms