Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms