Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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