Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms