Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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