Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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