Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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