Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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