Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms