Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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