Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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