Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTPN13Q12923 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTPN13Q12923 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTPN13Q12923 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTPN13Q12923 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTPN13Q12923 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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