Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms