Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms