Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms