Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms