Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms