Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms