Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHC1P78364 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHC1P78364 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHC1P78364 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHC1P78364 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms