Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCDC1P59894 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms