Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms