Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD2P49005 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD2P49005 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms