Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETFBP38117 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ETFBP38117 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ETFBP38117 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ETFBP38117 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms