Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms