Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms