Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms