Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PEX2P28328 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PEX2P28328 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEX2P28328 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PEX2P28328 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms