Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms