Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CXCL3P19876 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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