Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EGR1P18146 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EGR1P18146 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EGR1P18146 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms