Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC175P0C221 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms