Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA4P06727 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms