Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms