Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3AO14802 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms