Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM247A6NEH6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms