Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms