Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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KCNIP3Q9Y2W7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KCNIP3Q9Y2W7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KCNIP3Q9Y2W7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KCNIP3Q9Y2W7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KCNIP3Q9Y2W7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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KCNIP3Q9Y2W7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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