Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMG5Q9UPR3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms