Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms