Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PADI4Q9UM07 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms