Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXL4Q9UKA2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms