Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms