Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms