Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms