Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms