Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms